Ⅰ PDB数据库网址是什么

http://www.uniprot.org/
新的“联合蛋白质数据库”预计在三年内建成，美国国家卫生研究所已决定为这项计划斥资1500万美元。这一全球性数据库有望在2003年年底初步在因特网上开放，各国研究人
员可通过访问其网址www.uniprot.org，免费获取信息。(新浪网 2002年11月01日)
蛋白质数据库（Protein Data Bank, PDB）是一个生物大分子，如蛋白质和核酸，的数据库。这些数据包括X光晶体衍射或者NMR核磁共振显示以及由全世界生物学家和生物化学家上传，在网上，它们可以通过PBD的会员组织（PDBe, PDBj, RCSB）免费获取。PDB是由一个叫做世界蛋白质数据库（Worldwide Protein Data Bank, wwPDB）管理。PDB是结构生物（如结构基因组学）的一个关键性资源。大部分学术刊物，以及一些官方科研机构[如美国的国立卫生研究院（NIH）]，现在都要求科学家将它们研究的蛋白质、核酸结构上传到PDB
从PDB的网站上，可以通过蛋白质的编号查找到相应的3D结构，并可以将这个结构图下载到电脑中，通过PyMol、RasMol、Chimera、VMD、Swiss-PdbViewer等软件查看、编辑。 从PDB网站上下载的3D结构图的后缀名为.pdb。

Ⅱ 什么是生物信息学中的二级数据库

根据需要从一级数据库中搜集对象的相关数据集合而成的就是二级数据库。

像genebank,EMBL这种专都是不加选择的属一级数据库，只要是实验获得的，不管什么东西的序列，哪怕是不完整的序列都能上传，而且它们的数据也有可能有重复。如果有某个人专门研究细菌的鉴定，需要用到正式被认可的16srDNA序列，为了研究方便，把这些一级数据库的各个种类细菌的公认标准16srDNA序列的数据进行整理，重新构建了一个数据库，这就是所谓的二级数据库。如果不构建，直接用一级数据库做blast，就会得出很多未被承认甚至不完整的序列，还要人工一个个看过去，找出公认的标准序列，这样就很麻烦。我举得例子在现实中就是韩国的EzTaxon。